農研機構の親子推定研究とゲノム研究は、外見や従来の名称だけでは分からない柑橘の関係を示しています。栽培柑橘は交雑が複雑なため、全てを一本の枝分かれの木で説明するより、確認された交配を個別に示す方が適切です。

同じ親の組合せからも異なる個体・品種が生まれます。水晶文旦については、従来よく書かれていた親の組合せと遺伝的検討の結果に不整合があり、未確定として扱います。